Electron-phonon interactions on diamond 6x6x6 supercell

Problems running VASP: crashes, internal errors, "wrong" results.

Moderators: Global Moderator, Moderator

Locked
Message
Author
alex_ganose
Newbie
Newbie
Posts: 2
Joined: Mon Nov 29, 2021 9:15 am

Electron-phonon interactions on diamond 6x6x6 supercell

#1 Post by alex_ganose » Mon Nov 29, 2021 10:59 am

Hi,

I'm trying to reproduce the one-shot electron-phonon calculations on diamond from this paper: https://iopscience.iop.org/article/10.1 ... 630/aaf53f

I'm following the steps outlined in the wiki here: wiki/index.php/Band_gap_renormalization ... hot_method

Everything in the wiki tutorial works fine. However, when I try using a 6x6x6 supercell I get the following error: "HNFORM: k-point generating vectors and reciprocal lattice are incommensurate."

I've attached the 6x6x6 supercell, INCAR, and KPOINTS file. I'm doing a gamma only calculation using vasp_gam and exactly the same INCAR file as in the tutorial. Note, I also tried using a 2x2x2 gamma-centred k-point mesh but I got the same error.

This error is unusual because the 4x4x4 and 5x5x5 supercells work fine. Also, the paper linked above includes results for a 6x6x6. Can help me understand how these results were generated?

Best,
Alex


INCAR

Code: Select all

System = cd-C
PREC = Accurate
ALGO = FAST
ISMEAR = 0
SIGMA = 0.1;
IBRION = 6
PHON_LMC = .TRUE.
PHON_NSTRUCT = 0
PHON_NTLIST = 1
PHON_TLIST = 0.0
KPOINTS

Code: Select all

Gamma only k-point mesh
0
Gamma
1 1 1
POSCAR

Code: Select all

C432
1.0
0.000000 10.663044 10.663044
10.663044 0.000000 10.663044
10.663044 10.663044 0.000000
C
432
direct
0.041667 0.041667 0.041667
0.041667 0.041667 0.208333
0.041667 0.041667 0.375000
0.041667 0.041667 0.541667
0.041667 0.041667 0.708333
0.041667 0.041667 0.875000
0.041667 0.208333 0.041667
0.041667 0.208333 0.208333
0.041667 0.208333 0.375000
0.041667 0.208333 0.541667
0.041667 0.208333 0.708333
0.041667 0.208333 0.875000
0.041667 0.375000 0.041667
0.041667 0.375000 0.208333
0.041667 0.375000 0.375000
0.041667 0.375000 0.541667
0.041667 0.375000 0.708333
0.041667 0.375000 0.875000
0.041667 0.541667 0.041667
0.041667 0.541667 0.208333
0.041667 0.541667 0.375000
0.041667 0.541667 0.541667
0.041667 0.541667 0.708333
0.041667 0.541667 0.875000
0.041667 0.708333 0.041667
0.041667 0.708333 0.208333
0.041667 0.708333 0.375000
0.041667 0.708333 0.541667
0.041667 0.708333 0.708333
0.041667 0.708333 0.875000
0.041667 0.875000 0.041667
0.041667 0.875000 0.208333
0.041667 0.875000 0.375000
0.041667 0.875000 0.541667
0.041667 0.875000 0.708333
0.041667 0.875000 0.875000
0.208333 0.041667 0.041667
0.208333 0.041667 0.208333
0.208333 0.041667 0.375000
0.208333 0.041667 0.541667
0.208333 0.041667 0.708333
0.208333 0.041667 0.875000
0.208333 0.208333 0.041667
0.208333 0.208333 0.208333
0.208333 0.208333 0.375000
0.208333 0.208333 0.541667
0.208333 0.208333 0.708333
0.208333 0.208333 0.875000
0.208333 0.375000 0.041667
0.208333 0.375000 0.208333
0.208333 0.375000 0.375000
0.208333 0.375000 0.541667
0.208333 0.375000 0.708333
0.208333 0.375000 0.875000
0.208333 0.541667 0.041667
0.208333 0.541667 0.208333
0.208333 0.541667 0.375000
0.208333 0.541667 0.541667
0.208333 0.541667 0.708333
0.208333 0.541667 0.875000
0.208333 0.708333 0.041667
0.208333 0.708333 0.208333
0.208333 0.708333 0.375000
0.208333 0.708333 0.541667
0.208333 0.708333 0.708333
0.208333 0.708333 0.875000
0.208333 0.875000 0.041667
0.208333 0.875000 0.208333
0.208333 0.875000 0.375000
0.208333 0.875000 0.541667
0.208333 0.875000 0.708333
0.208333 0.875000 0.875000
0.375000 0.041667 0.041667
0.375000 0.041667 0.208333
0.375000 0.041667 0.375000
0.375000 0.041667 0.541667
0.375000 0.041667 0.708333
0.375000 0.041667 0.875000
0.375000 0.208333 0.041667
0.375000 0.208333 0.208333
0.375000 0.208333 0.375000
0.375000 0.208333 0.541667
0.375000 0.208333 0.708333
0.375000 0.208333 0.875000
0.375000 0.375000 0.041667
0.375000 0.375000 0.208333
0.375000 0.375000 0.375000
0.375000 0.375000 0.541667
0.375000 0.375000 0.708333
0.375000 0.375000 0.875000
0.375000 0.541667 0.041667
0.375000 0.541667 0.208333
0.375000 0.541667 0.375000
0.375000 0.541667 0.541667
0.375000 0.541667 0.708333
0.375000 0.541667 0.875000
0.375000 0.708333 0.041667
0.375000 0.708333 0.208333
0.375000 0.708333 0.375000
0.375000 0.708333 0.541667
0.375000 0.708333 0.708333
0.375000 0.708333 0.875000
0.375000 0.875000 0.041667
0.375000 0.875000 0.208333
0.375000 0.875000 0.375000
0.375000 0.875000 0.541667
0.375000 0.875000 0.708333
0.375000 0.875000 0.875000
0.541667 0.041667 0.041667
0.541667 0.041667 0.208333
0.541667 0.041667 0.375000
0.541667 0.041667 0.541667
0.541667 0.041667 0.708333
0.541667 0.041667 0.875000
0.541667 0.208333 0.041667
0.541667 0.208333 0.208333
0.541667 0.208333 0.375000
0.541667 0.208333 0.541667
0.541667 0.208333 0.708333
0.541667 0.208333 0.875000
0.541667 0.375000 0.041667
0.541667 0.375000 0.208333
0.541667 0.375000 0.375000
0.541667 0.375000 0.541667
0.541667 0.375000 0.708333
0.541667 0.375000 0.875000
0.541667 0.541667 0.041667
0.541667 0.541667 0.208333
0.541667 0.541667 0.375000
0.541667 0.541667 0.541667
0.541667 0.541667 0.708333
0.541667 0.541667 0.875000
0.541667 0.708333 0.041667
0.541667 0.708333 0.208333
0.541667 0.708333 0.375000
0.541667 0.708333 0.541667
0.541667 0.708333 0.708333
0.541667 0.708333 0.875000
0.541667 0.875000 0.041667
0.541667 0.875000 0.208333
0.541667 0.875000 0.375000
0.541667 0.875000 0.541667
0.541667 0.875000 0.708333
0.541667 0.875000 0.875000
0.708333 0.041667 0.041667
0.708333 0.041667 0.208333
0.708333 0.041667 0.375000
0.708333 0.041667 0.541667
0.708333 0.041667 0.708333
0.708333 0.041667 0.875000
0.708333 0.208333 0.041667
0.708333 0.208333 0.208333
0.708333 0.208333 0.375000
0.708333 0.208333 0.541667
0.708333 0.208333 0.708333
0.708333 0.208333 0.875000
0.708333 0.375000 0.041667
0.708333 0.375000 0.208333
0.708333 0.375000 0.375000
0.708333 0.375000 0.541667
0.708333 0.375000 0.708333
0.708333 0.375000 0.875000
0.708333 0.541667 0.041667
0.708333 0.541667 0.208333
0.708333 0.541667 0.375000
0.708333 0.541667 0.541667
0.708333 0.541667 0.708333
0.708333 0.541667 0.875000
0.708333 0.708333 0.041667
0.708333 0.708333 0.208333
0.708333 0.708333 0.375000
0.708333 0.708333 0.541667
0.708333 0.708333 0.708333
0.708333 0.708333 0.875000
0.708333 0.875000 0.041667
0.708333 0.875000 0.208333
0.708333 0.875000 0.375000
0.708333 0.875000 0.541667
0.708333 0.875000 0.708333
0.708333 0.875000 0.875000
0.875000 0.041667 0.041667
0.875000 0.041667 0.208333
0.875000 0.041667 0.375000
0.875000 0.041667 0.541667
0.875000 0.041667 0.708333
0.875000 0.041667 0.875000
0.875000 0.208333 0.041667
0.875000 0.208333 0.208333
0.875000 0.208333 0.375000
0.875000 0.208333 0.541667
0.875000 0.208333 0.708333
0.875000 0.208333 0.875000
0.875000 0.375000 0.041667
0.875000 0.375000 0.208333
0.875000 0.375000 0.375000
0.875000 0.375000 0.541667
0.875000 0.375000 0.708333
0.875000 0.375000 0.875000
0.875000 0.541667 0.041667
0.875000 0.541667 0.208333
0.875000 0.541667 0.375000
0.875000 0.541667 0.541667
0.875000 0.541667 0.708333
0.875000 0.541667 0.875000
0.875000 0.708333 0.041667
0.875000 0.708333 0.208333
0.875000 0.708333 0.375000
0.875000 0.708333 0.541667
0.875000 0.708333 0.708333
0.875000 0.708333 0.875000
0.875000 0.875000 0.041667
0.875000 0.875000 0.208333
0.875000 0.875000 0.375000
0.875000 0.875000 0.541667
0.875000 0.875000 0.708333
0.875000 0.875000 0.875000
0.000000 0.000000 0.000000
0.000000 0.000000 0.166667
0.000000 0.000000 0.333333
0.000000 0.000000 0.500000
0.000000 0.000000 0.666667
0.000000 0.000000 0.833333
0.000000 0.166667 0.000000
0.000000 0.166667 0.166667
0.000000 0.166667 0.333333
0.000000 0.166667 0.500000
0.000000 0.166667 0.666667
0.000000 0.166667 0.833333
0.000000 0.333333 0.000000
0.000000 0.333333 0.166667
0.000000 0.333333 0.333333
0.000000 0.333333 0.500000
0.000000 0.333333 0.666667
0.000000 0.333333 0.833333
0.000000 0.500000 0.000000
0.000000 0.500000 0.166667
0.000000 0.500000 0.333333
0.000000 0.500000 0.500000
0.000000 0.500000 0.666667
0.000000 0.500000 0.833333
0.000000 0.666667 0.000000
0.000000 0.666667 0.166667
0.000000 0.666667 0.333333
0.000000 0.666667 0.500000
0.000000 0.666667 0.666667
0.000000 0.666667 0.833333
0.000000 0.833333 0.000000
0.000000 0.833333 0.166667
0.000000 0.833333 0.333333
0.000000 0.833333 0.500000
0.000000 0.833333 0.666667
0.000000 0.833333 0.833333
0.166667 0.000000 0.000000
0.166667 0.000000 0.166667
0.166667 0.000000 0.333333
0.166667 0.000000 0.500000
0.166667 0.000000 0.666667
0.166667 0.000000 0.833333
0.166667 0.166667 0.000000
0.166667 0.166667 0.166667
0.166667 0.166667 0.333333
0.166667 0.166667 0.500000
0.166667 0.166667 0.666667
0.166667 0.166667 0.833333
0.166667 0.333333 0.000000
0.166667 0.333333 0.166667
0.166667 0.333333 0.333333
0.166667 0.333333 0.500000
0.166667 0.333333 0.666667
0.166667 0.333333 0.833333
0.166667 0.500000 0.000000
0.166667 0.500000 0.166667
0.166667 0.500000 0.333333
0.166667 0.500000 0.500000
0.166667 0.500000 0.666667
0.166667 0.500000 0.833333
0.166667 0.666667 0.000000
0.166667 0.666667 0.166667
0.166667 0.666667 0.333333
0.166667 0.666667 0.500000
0.166667 0.666667 0.666667
0.166667 0.666667 0.833333
0.166667 0.833333 0.000000
0.166667 0.833333 0.166667
0.166667 0.833333 0.333333
0.166667 0.833333 0.500000
0.166667 0.833333 0.666667
0.166667 0.833333 0.833333
0.333333 0.000000 0.000000
0.333333 0.000000 0.166667
0.333333 0.000000 0.333333
0.333333 0.000000 0.500000
0.333333 0.000000 0.666667
0.333333 0.000000 0.833333
0.333333 0.166667 0.000000
0.333333 0.166667 0.166667
0.333333 0.166667 0.333333
0.333333 0.166667 0.500000
0.333333 0.166667 0.666667
0.333333 0.166667 0.833333
0.333333 0.333333 0.000000
0.333333 0.333333 0.166667
0.333333 0.333333 0.333333
0.333333 0.333333 0.500000
0.333333 0.333333 0.666667
0.333333 0.333333 0.833333
0.333333 0.500000 0.000000
0.333333 0.500000 0.166667
0.333333 0.500000 0.333333
0.333333 0.500000 0.500000
0.333333 0.500000 0.666667
0.333333 0.500000 0.833333
0.333333 0.666667 0.000000
0.333333 0.666667 0.166667
0.333333 0.666667 0.333333
0.333333 0.666667 0.500000
0.333333 0.666667 0.666667
0.333333 0.666667 0.833333
0.333333 0.833333 0.000000
0.333333 0.833333 0.166667
0.333333 0.833333 0.333333
0.333333 0.833333 0.500000
0.333333 0.833333 0.666667
0.333333 0.833333 0.833333
0.500000 0.000000 0.000000
0.500000 0.000000 0.166667
0.500000 0.000000 0.333333
0.500000 0.000000 0.500000
0.500000 0.000000 0.666667
0.500000 0.000000 0.833333
0.500000 0.166667 0.000000
0.500000 0.166667 0.166667
0.500000 0.166667 0.333333
0.500000 0.166667 0.500000
0.500000 0.166667 0.666667
0.500000 0.166667 0.833333
0.500000 0.333333 0.000000
0.500000 0.333333 0.166667
0.500000 0.333333 0.333333
0.500000 0.333333 0.500000
0.500000 0.333333 0.666667
0.500000 0.333333 0.833333
0.500000 0.500000 0.000000
0.500000 0.500000 0.166667
0.500000 0.500000 0.333333
0.500000 0.500000 0.500000
0.500000 0.500000 0.666667
0.500000 0.500000 0.833333
0.500000 0.666667 0.000000
0.500000 0.666667 0.166667
0.500000 0.666667 0.333333
0.500000 0.666667 0.500000
0.500000 0.666667 0.666667
0.500000 0.666667 0.833333
0.500000 0.833333 0.000000
0.500000 0.833333 0.166667
0.500000 0.833333 0.333333
0.500000 0.833333 0.500000
0.500000 0.833333 0.666667
0.500000 0.833333 0.833333
0.666667 0.000000 0.000000
0.666667 0.000000 0.166667
0.666667 0.000000 0.333333
0.666667 0.000000 0.500000
0.666667 0.000000 0.666667
0.666667 0.000000 0.833333
0.666667 0.166667 0.000000
0.666667 0.166667 0.166667
0.666667 0.166667 0.333333
0.666667 0.166667 0.500000
0.666667 0.166667 0.666667
0.666667 0.166667 0.833333
0.666667 0.333333 0.000000
0.666667 0.333333 0.166667
0.666667 0.333333 0.333333
0.666667 0.333333 0.500000
0.666667 0.333333 0.666667
0.666667 0.333333 0.833333
0.666667 0.500000 0.000000
0.666667 0.500000 0.166667
0.666667 0.500000 0.333333
0.666667 0.500000 0.500000
0.666667 0.500000 0.666667
0.666667 0.500000 0.833333
0.666667 0.666667 0.000000
0.666667 0.666667 0.166667
0.666667 0.666667 0.333333
0.666667 0.666667 0.500000
0.666667 0.666667 0.666667
0.666667 0.666667 0.833333
0.666667 0.833333 0.000000
0.666667 0.833333 0.166667
0.666667 0.833333 0.333333
0.666667 0.833333 0.500000
0.666667 0.833333 0.666667
0.666667 0.833333 0.833333
0.833333 0.000000 0.000000
0.833333 0.000000 0.166667
0.833333 0.000000 0.333333
0.833333 0.000000 0.500000
0.833333 0.000000 0.666667
0.833333 0.000000 0.833333
0.833333 0.166667 0.000000
0.833333 0.166667 0.166667
0.833333 0.166667 0.333333
0.833333 0.166667 0.500000
0.833333 0.166667 0.666667
0.833333 0.166667 0.833333
0.833333 0.333333 0.000000
0.833333 0.333333 0.166667
0.833333 0.333333 0.333333
0.833333 0.333333 0.500000
0.833333 0.333333 0.666667
0.833333 0.333333 0.833333
0.833333 0.500000 0.000000
0.833333 0.500000 0.166667
0.833333 0.500000 0.333333
0.833333 0.500000 0.500000
0.833333 0.500000 0.666667
0.833333 0.500000 0.833333
0.833333 0.666667 0.000000
0.833333 0.666667 0.166667
0.833333 0.666667 0.333333
0.833333 0.666667 0.500000
0.833333 0.666667 0.666667
0.833333 0.666667 0.833333
0.833333 0.833333 0.000000
0.833333 0.833333 0.166667
0.833333 0.833333 0.333333
0.833333 0.833333 0.500000
0.833333 0.833333 0.666667
0.833333 0.833333 0.833333

alex_ganose
Newbie
Newbie
Posts: 2
Joined: Mon Nov 29, 2021 9:15 am

Re: Electron-phonon interactions on diamond 6x6x6 supercell

#2 Post by alex_ganose » Mon Nov 29, 2021 6:54 pm

I figured out the issue. The program I was using to generate the supercell POSCAR only wrote the lattice constants and atomic positions to 8 decimal places. When the POSCAR was written with 16 decimal places the calculation completed successfully.

ferenc_karsai
Global Moderator
Global Moderator
Posts: 422
Joined: Mon Nov 04, 2019 12:44 pm

Re: Electron-phonon interactions on diamond 6x6x6 supercell

#3 Post by ferenc_karsai » Wed Dec 15, 2021 9:45 am

Thanks for posting it that you figured it out. It is good that it works now.

Locked